วิชาการ.คอม - ชีวสารสนเทศ (Bioinformatics) ในยุคหลังจีโนม (post-genomic era) (ประโยชน์ของชีวสารสนเทศ)

ชีวสารสนเทศ (Bioinformatics) ในยุคหลังจีโนม (post-genomic era)

การนำความรู้ด้านเทคโนโลยีสารสนเทศมาใช้ในการศึกษาข้อมูลที่ได้จากการวิจัยด้านชีวภาพ (Biological Science) ทำให้ก่อให้เกิดองค์ความรู้ใหม่ๆ โดยเฉพาะอย่างยิ่งต่องานวิจัยทางด้านวิทยาศาสตร์ชีวภาพและการแพทย์

ผู้เขียน: Nattawut ชมแล้ว: 32,056 ครั้ง

post ครั้งแรก: Tue 17 August 2004, 3:14 pm ปรับปรุงล่าสุด: Tue 17 August 2004, 3:14 pm

อยู่ในส่วน: ชีววิทยา

สารบัญ

หน้า : 1 ชีวสารสนเทศ (Bioinformatics)
หน้า : 2 ยุคหลังจีโนม
หน้า : 3 ประโยชน์ของชีวสารสนเทศ
หน้า : 4 การใช้ขีวสารสนเทศ
หน้า : 5 การใช้ชีวสารสนเทศ (ต่อ)

หน้าที่ 3 - ประโยชน์ของชีวสารสนเทศ

เจ้าของงานเขียน แ้ก้ไขหน้านี้ ได้ที่นี่

การศึกษาจีโนมในสิ่งมีชีวิตชนิดต่าง ๆ ( http://gdbwww.gdb.org/)

งานวิจัยที่เกี่ยวข้องกับจีโนมมีหลายประเภท แต่ที่ได้รับการกล่าวถึงอย่างมากในขณะนี้คือการหาลำดับคู่เบสในสาย DNA ทั้งหมด (genome sequencing) นอกจากจีโนมมนุษย์ซึ่งมีการหาลำดับได้เกือบหมดแล้วนั้น ยังมีการศึกษาจีโนมของสิ่งมีชีวิตชนิดอื่น ๆ อีก ตัวอย่างเช่น:

-.หนู มีจีโนม ขนาดเล็กกว่ามนุษย์เล็กน้อย ขนาดของจีโนมประมาณ 3 พันล้านคู่เบส บรรจุอยู่ในโครโมโซม 20 คู่ http://www.informatics.jax.org/

-แมลงหวี่ Drosophila มีจีโนมขนาดประมาณ 160 ล้านคู่เบส และมีโครโมโซม 4 คู่ http://www.fruitfly.org/

-หนอนตัวกลม C. elegans มีจีโนมขนาดประมาณ 100 ล้านคู่เบส http://www.sanger.ac.uk/Projects/C_elegans/

-ยีสต์ S. cerevisiae มีจีโนมขนาดประมาณ 12.5 ล้านคู่เบส http://www.yeastgenome.org/

-แบคทีเรีย E. coli มีโครโมโซมเดี่ยว และมีจีโนมขนาดเล็กเพียง 5 ล้านคู่ http://www.genome.wisc.edu/

- จีโนม Burkholderia pseudomallei ซึ่งเป็นสาเหตุของโรค melioidosis ที่เป็นโรคติดเชื้อสำคัญในประเทศไทย http://www.sanger.ac.uk/Projects/B_pseudomallei/

- โครงการจีโนม ข้าว http://rgp.dna.affrc.go.jp/

- โครงการจีโนม Plasmodium falciparum http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview/map_search.cgi?taxid=5833

- โครงการจีโนม Arabidopsis thaliana http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview/map_search.cgi?taxid=3702

การใช้ชีวสารสนเทศมาช่วยในการถอดลำดับจีโนม

การเรียงตัวของคู่เบส (sequencing) ทำโดยตัดเส้น DNA เป็นชิ้น ๆ แล้วป้อนเข้าไปให้เครื่องอ่านอัตโนมัติอ่านถอดอักษรทีละตัวๆของรหัสทางพันธุ์กรรม จากนั้นทำการประกอบเข้าด้วยกันใหม่ (assembly) นำตัวอักษรที่แกะแล้วในแต่ละชิ้นของเส้น DNA มาประกอบเรียงกันใหม่จนกระทั่งได้ลำดับคู่เบสของ DNA ทั้งหมด

ขั้นสุดท้ายทำการระบุตำแหน่งของยีน (annotation) โดย ชีวสารสนเทศ เพื่อทราบการเรียงลำดับของ DNA ทั้งหมดแล้ว จึงค้นหาตำแหน่งของยีน ในข้อมูลจีโนมทั้งหมด ทั้งนี้อาจทำโดยการค้นหา รหัสบ่งชี้การเริ่มต้นและสิ้นสุดของยีน หรือโดยการเปรียบเทียบกับยีนที่รู้จัก นักวิทยาศาสตร์ต้องรวบรวมเก็บข้อมูล ทำการวิเคราะห์และแปลผลที่ได้

ปัจจุบันเรามีข้อมูลลำดับนิวคลีโอไทด์บนดีเอ็นเอ (DNA sequence data) ของสิ่งมีชีวิตหลายชนิดอย่างครบถ้วน แต่เราจะทำอย่างไรจึงจะบอกได้ว่าตรงส่วนไหนของดีเอ็นเอทำหน้าที่ควบคุมกระบวนการทางชีวเคมีอะไรบ้างในสิ่งมีชีวิต ทำให้นักวิทยาศาสตร์ต้องพึ่งคอมพิวเตอร์และเทคโนโลยีสารสนเทศเพื่อตามให้ทันข้อมูลที่มีการเจริญเติบโตและเปลี่ยนแปลงอย่างรวดเร็ว อินเทอร์เน็ตโดยเฉพาะอย่างยิ่ง World Wide Web ทำให้นักวิทยาศาสตร์สามารถเข้าถึงข้อมูลเหล่านั้นได้ และนี่คือที่มาของศาสตร์อีกแขนงหนึ่งที่เรียกว่า Computation biology และถูกพัฒนาเรื่อยมาจนเป็น Bioinformatics ในปัจจุบัน

<<< หน้าก่อนนี้ (หน้า 2)

หน้าถัดไป (หน้า 4) >>>

^*หมายเหตุ งานเขียนชิ้นนี้ ได้รับการคุ้มครองสิทธิตามพระราชบัญญัติคุ้มครองสิทธิทางปัญญา โดยลิขสิทธิเป็นของผู้เขียน ที่ให้เกียรตินำเผยแพร่ผ่าน วิชาการ.คอม เรามีความยินดีและอนุญาตให้ทำซ้ำหรือเผยแพร่ต่อเพื่อประโยชน์ทางการศึกษาเท่านั้น กรุณาให้เกียรติผู้เขียน โดยอ้างชื่อผู้เขียนและ วิชาการ.คอม (www.vcharkarn.com) ทุกครั้งที่ทำการเผยแพร่ต่อ ห้ามนำส่วนหนึ่งส่วนใดไปเผยแพร่ต่อในสื่อที่เอื้อประโยชน์ทางธุรกิจก่อนได้รับอนุญาต ขอขอบคุณที่ร่วมกันช่วยสร้างให้สังคมไทยเป็นสังคมแห่งปัญญา

ยังไม่มีความเห็นเพิ่มเติม

กรุณา login เพื่อ comment งานเขียนนี้

???? สมัครสมาชิก ฟรี ตลอดชีพ